Родился 20 сентября 1944 г. в семье полковника донских казачих войск Алексея Михайловича Протопопова и врача Ольги Николаевны (урожд. Грузевич-Нечай) во время эвакуации Русского корпуса из Сербии. В 1949 г. переехал с семьей в Австралию. Михаил Протопопов избежал репатриации русского казачества, и с матерью и братом оказался в лагере для перемещенных лиц (Ди-Пи) в г. Парш близ Зальцбурга (Австрия). В 1949 г. они переехали в Австралию, и, в конце концов, поселились в г. Мельбурн (шт. Виктория). М.А. Протопопов окончил Бэрвуд (Burwood) педагогический колледж, Мельбурнский университет и Университет штата Виктория по специальностям образование, управление и богословие. Магистр философии. С 1964 по 1989 гг. работал школьным учителем, а с 1977 г. руководил рядом государственных школ в Австралии. 30 апреля 1972 г. рукоположен в диаконы. Одновременно продолжал преподавательскую работу, но в 1989 г. был вынужден оставить ее после двух сердечных приступов и вышел в отставку. 23 декабря 1975 г. был рукоположен в священники и назначен на служение в церковь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» в районе Белл-Парк в г. Джилонг (шт. Виктория, Австралия) в юрисдикции Русской Православной Церкви Заграницей (РПЦЗ). Он также окормлял приходы в гг. Хобарт (остров Тасмания) и Канберра (шт. Австралийская столичная территория). 1 февраля 1982 г. переведен в церковь Успения Пресвятой Богородицы в г. Данденонг (шт. Виктория, Австралия) и занимался строительством новой церкви в г. Данденонг. Член епархиального совета Австралийско-Новозеландской епархии. Администратор Австралийской епархии РПЦЗ и с 1988 г. благочинный Южного благочиннического округа Австралийской епархии РПЦЗ (штаты Виктория, Западная и Южная Австралия, Австралийская столичная территория, Тасмания). Кроме того, исполнял обязанности настоятеля Свято-Крестовоздвиженской церкви в г. Хобарт. Председатель правления Русского благотворительного общества имени св. прав. Иоанна Кронштадтского (г. Мельбурн (шт. Виктория, Австралия)). Составил и издал четыре тома биографий и проповедей архипастырей Австралийско-Новозеландской епархии (конец 1990-х гг.). Делегат IV Всезарубежного Собора Русской Православной Церкви Заграницей (Май 2006 г.) от Австралийской епархии РПЦЗ. Вице-председатель Собора. Старший преподаватель богословия Мельбурнского института православных христианских исследований. Проживает в г. Кейсборо (Австралия).