Родился 26 октября 1897 г. в Москве в семье священника. Окончил Московское духовное училище. С 1918 по 1922 гг. на гражданской службе. В 1922 году поступил в московский Свято-Данилов монастырь. Был послушником ректора Петроградской духовной академии епископа Федора (Поздеевского), который жил в то время в Даниловом монастыре в Москве. Принял постриг (1925 (по другим данным, 1923)). Иеродиакон (1925). Иеромонах (1925). Секретарь Московской Патриархии (1926). Настоятель храма в г. Орехово-Зуево (1930). С 1931 г. редактор "Журнала Московской Патриархии". Настоятель Воскресенского храма в Сокольниках (1932-1933). Архимандрит. В 1933 г. хиротонисан во епископа Коломенского, викария Московской епархии. Епископ Бронницкий (1934), Дмитровский (1936). Архиепископ (1937). Митрополит Виленский и Литовский, экзарх Латвии и Эстонии (1941). Оказался на оккупированных территориях. Настоятель Воскресенского храма в Сокольниках (1932-1933). Архимандрит (1933 (?)). Епископ Коломенский, викарий Московской епархии (1933), Бронницкий (1934), Дмитровский (1936) (по данным В. Алексеева, в 1929 году хиротонисан во епископа Дмитровского). (В. Алексеев указывает, что в 1935 году владыка Сергий был арестован, но затем освобожден благодаря ходатайству его матери.) Архиепископ (1937). В 1939 году член Св. Синода, состоящего в то время из четырех иерархов. Около 1939 г. был направлен на служение в Латвию. Митрополит Виленский и Литовский, экзарх Латвии и Эстонии (1941). Во время второй мировой войны отказался от эвакуации. В первые дни оккупации немцами был арестован, однако через короткое время отпущен. В 1942 году создает на оккупированных территориях епископат на автономных началах, поминая за богослужением митрополита, а затем патриарха Сергия (Страгородского). Окормлял Псковскую православную миссию. Был убит 29 апреля 1944 г. на шоссе между Вильнюсом и Каунасом во время его поездки в Ригу с протодьяконом Редикульчевым и его женой на похороны друга владыки Сергия, художника Смирнов. Обстоятельства убийства до настоящего времени не выяснены. Похоронен около храма на Покровском кладбище в Риге.