Родился 6 (18) января 1871 г. в с. Дубокрай Витебской губ. в семье дьячка. Окончил Витебскую духовную семинарию. Псаломщик (1891). Священник (1895). Настоятель Суворовской церкви в Санкт-Петербурге. Окончил Санкт-Петербургскую духовную академию (1902). Во время Русско-японской войны был полковым священником, дивизионным благочинным и под конец главным священником Манчжурской армии. Законоучитель в Смольном институте (Санкт-Петербург) (1906-1910). Профессор богословия Историко-филологического института (Санкт-Петербург) (1910). Член духовного правления военного протопресвитера (1910). Протопресвитер военного и морского духовенства Российской империи (протопресвитер армии и флота) (1911). Член Синода (1915-1917). Окормлял военное духовенство в Добровольческой армии Деникина до 1919 г., когда эти функции были переданы епископу Вениамину (Федченкову). Член Временного высшего церковного управления (ВЦУ) на юго-востоке России (1919). Эмигрировал в Болгарию. Профессор богословского факультета Софийского университета (1920). Был приглашен на Карловацкий Всезаграничный церковный собор (1921), но не получил визу и в заседаниях участия не принимал. Председатель Софийской академической группы (1926). В 1927 г. перешел из Русской Православной Церкви Заграницей в юрисдикцию Болгарской Православной Церкви. Скончался 2 октября 1951 г. в Софии.

Архивные материалы протопресвитера Петра Шавельского хранятся в Государственном архиве Российской Федерации (ГАРФ) (Ф. 1486) и в Бахметевском архиве российской и восточно-европейской истории и культуры Колумбийского университета в Нью-Йорке.