Родился 26 марта 1905 г. в Санкт-Петербурге. Сын Е. П. Ковалевского и брат П.Е. Ковалевского и М.Е. Ковалевского. Эмигрировал с семьей во Францию в 1920 г. Жил в г. Ницца, затем переехал в Париж. Окончил Сорбонну и Свято-Сергиевский православный богословский институт в Париже. Церковный деятель, иконописец, регент. Принимал активное участие в организации православного прихода в г. Нант (Франция). Рукоположен в священники в 1937 г. Член братства св. Фотия в Париже. Организовал православные общины западного ("галликанского") обряда. Протоиерей (1945). Доктор богословия "гонорис кауза" Московского Патриархата (вместе с В. Н. Лосским и В. Н. Ильиным). Основал в 1947 г. и возглавлял Православный институт (французский) св. Дионисия с его основания в 1947 г. до своей кончины. В 1953 г. прот. Евграф Ковалевский вместе со значительной частью верующих общин западного обряда вышел из-под омофора Московской Патриархии и образуют "Французскую Кафолическую Православную Церковь" (ФКПЦ) ("Eglise catholique orthodoxe de France (ECOF)"). До 1956 г. прот. Евграф находился в юрисдикции Русского Западно-Европейского экзархата Константинопольского Патриархата, а затем в течении нескольких лет общины, подчинявшиеся прот. Евграфу оставались независимыми, пока в 1960 г. их не принял под свой омофор архиепископ Сан-Францискский Иоанн (Максимович) (Русская Православная Церковь Заграницей (РПЦЗ)). 11 ноября 1964 г. прот. Евграфа Ковалевского (с согласия синода РПЦЗ) рукополагают во епископа Сен-Денисского с именем Иоанн. После кончины архиепископа Иоанна (Максимовича) в 1966 году у еп. Иоанна (Ковалевского) возникает конфликт с РПЦЗ, и "Французская католическая православная церковь" вновь становится независимой. Скончался в Париже 30 января 1970 г. Его памяти посвящен номер журнала "Presence Orthodox" (Paris, 1970. N 9-10), а также книга "Jean de Saint Denis" (Paris, 1970).

[После смерти еп. Иоанна (Ковалевского) группа начала искать контакта с каноническим православием, и в 1972 году была принята в качестве автономной церкви в состав Румынского Патриархата. В 1972 г. для французов рукопологается новый епископ Сен-Дени - Герман (Жиль Бертран-Харди). В 1988 г. (из-за позиции Константинополя) возник конфликт с Румынской Патриархией, который завершился в 1993 году разрывом отношений. С 1993 г. ФКПЦ вновь становится независимой юрисдикией, а часть приходов осталась в составе Румынского Патриархата].